Программно создаем и компилируем(приложения и библиотеки).

public static bool CompileExecutable(String sourceName)
{
    // Файл который вы скомпилировать
    FileInfo sourceFile = new FileInfo(sourceName);
    
    CodeDomProvider provider = CodeDomProvider.CreateProvider("CSharp");

    // Создаем логическую переменную чтобы увидеть, были ли ошибки при компиляции
    bool compileOk = false;

     //Создаем имя будущего исполняемого файла
     String exeName = String.Format(@"{0}\{1}.exe",
     System.Environment.CurrentDirectory, sourceFile.Name.Replace(".", "_"));

     //Создаем переменную cp, чтобы задать параметры компилятора
     CompilerParameters cp = new CompilerParameters();

     //Вы можете скомпилировать как dll так и exe фай. Мы будем компилировать exe файл, поэтому выставляем компилятору true
     cp.GenerateExecutable = true;

     //Указываем будущего файла
     cp.OutputAssembly = exeName;

     //Save the exe as a physical file
     cp.GenerateInMemory = false;

     //Set the compliere to not treat warranings as erros
     cp.TreatWarningsAsErrors = false;

     //Make it compile
     CompilerResults cr = provider.CompileAssemblyFromFile(cp, sourceName);

     //if there are more then 0 erros...
     if (cr.Errors.Count > 0)
     {
         //A message box shows the erros that occured
         MessageBox.Show("Errors building {0} into {1}" +
             sourceName + cr.PathToAssembly);

         //for each error that occured in the code make a separete message box
         foreach (CompilerError ce in cr.Errors)
         {
             MessageBox.Show("  {0}" + ce.ToString());
         }
     }

     //Если нет ошибок, выводим сообщение
     else
     {
         //Выводим сообщение об успешной компиляции
         MessageBox.Show("Source {0} built into {1} successfully." +
             sourceName + cr.PathToAssembly);
     }

     //Проверка были ли ошибки при компиляции
     if (cr.Errors.Count > 0)
     {         
         compileOk = false;
     }

     //if there are no erros...
     else
     {         
         compileOk = true;
     }

     //сообщаем об успешном выполнении компиляции
     return compileOk;
}

Вызов функции:

private void button1_Click_1(object sender, EventArgs e)
{
    //Создаем и записываем в файл .cs необходымый для компиляции код
    TextWriter writer = new StreamWriter(Application.StartupPath + "\\myExe.cs");
    
    writer.WriteLine("using System;");
    writer.WriteLine("using System.Collections.Generic;");
    writer.WriteLine("using System.Text;");
    writer.WriteLine("namespace TestAppi");
    writer.WriteLine("{");
    writer.WriteLine("class Program");
    writer.WriteLine("{");
    writer.WriteLine("static void Main(string[] args)");
    writer.WriteLine("{");
    writer.WriteLine("Console.WriteLine(\"Hello World\");");
    writer.WriteLine("Console.ReadLine();");
    writer.WriteLine("} } }");

    //Закрываем поток записи в файл и сохраняем его
    writer.Close();   
    
    string file = Application.StartupPath + "\\myExe.cs";

    //Компиляция
    CompileExecutable(file);
}